Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD2P0DJD1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RGPD2P0DJD1 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms