Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPIND1P05546 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPIND1P05546 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPIND1P05546 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPIND1P05546 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERPIND1P05546 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms