Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APODP05090 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APODP05090 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms