Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C6orf47O95873 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C6orf47O95873 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms