Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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