Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JRKO75564 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JRKO75564 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JRKO75564 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms