Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL4O60488 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL4O60488 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms