Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms