Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FANCAO15360 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FANCAO15360 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms