Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CLDN34H7C241 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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