Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
B4DXG7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
B4DXG7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
B4DXG7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
B4DXG7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
B4DXG7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
B4DXG7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
B4DXG7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms