Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DGG1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DGG1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DGG1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms