Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD1B0YJ81 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms