Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms