Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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