Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms