Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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