Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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RABGEF1Q9UJ41 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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RABGEF1Q9UJ41 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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RABGEF1Q9UJ41 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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RABGEF1Q9UJ41 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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RABGEF1Q9UJ41 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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RABGEF1Q9UJ41 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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RABGEF1Q9UJ41 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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RABGEF1Q9UJ41 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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RABGEF1Q9UJ41 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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RABGEF1Q9UJ41 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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