Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms