Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP36Q9P275 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms