Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC180Q9P1Z9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms