Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTLNQ9NXG0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTLNQ9NXG0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTLNQ9NXG0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms