Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM248Q9NWD8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms