Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP44Q9C0F1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP44Q9C0F1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms