Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms