Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PACSIN1Q9BY11 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PACSIN1Q9BY11 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms