Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms