Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VN1R3Q9BXE9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms