Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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C9orf16Q9BUW7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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