Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM175Q9BSA9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms