Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms