Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms