Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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