Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCARF2Q96GP6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCARF2Q96GP6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms