Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIRT1Q96EB6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRT1Q96EB6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms