Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms