Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms