Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AP000844.2-201ENST00000419440 509 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 HDAC2-AS2-211ENST00000520034 790 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC100843.2-201ENST00000589084 324 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 PSMC1P1-201ENST00000478110 1320 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC026401.3-201ENST00000624682 882 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 UBE2E1-203ENST00000424381 1224 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ALDH1L1-AS1-201ENST00000512384 437 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNKSR2Q8WXI2 AC007728.2-202ENST00000567728 1150 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms