Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM41Q8WV44 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms