Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf43Q8TAL5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf43Q8TAL5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms