Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 FAM81A-201ENST00000288228 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ARHGAP27-212ENST00000532038 3694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 C1orf94-201ENST00000373374 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LRRTM4-202ENST00000409093 2247 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PRPS2-202ENST00000380668 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TIMMDC1-208ENST00000494664 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 EOMES-203ENST00000461503 2080 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 GDNF-AS1-204ENST00000637595 1886 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ADAMTS20-202ENST00000395541 4633 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC010746.1-201ENST00000442984 452 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 Metazoa_SRP.135-201ENST00000616324 269 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 RPGRIP1L-210ENST00000568653 2429 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 FYN-201ENST00000229471 2009 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LINC02080-201ENST00000585863 3085 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SLC16A7-214ENST00000552024 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CLNS1A-204ENST00000525428 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LCA5-203ENST00000467898 2894 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CPT1A-206ENST00000540367 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC243967.3-201ENST00000614316 2265 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PPP1CC-204ENST00000546933 2154 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TCF4-211ENST00000561992 2184 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TBC1D28-202ENST00000405044 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CSF3R-205ENST00000373106 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 ITIH4-202ENST00000406595 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 INMT-MINDY4-202ENST00000458257 2877 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 C3orf20-201ENST00000253697 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MIR646HG-207ENST00000432910 2043 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 KBTBD12-201ENST00000343941 4121 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 PCDHGA5-202ENST00000611914 3552 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 LILRB2-201ENST00000314446 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 CNPY1-201ENST00000321736 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 GRAMD1B-203ENST00000456860 2805 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 WEE2-AS1-209ENST00000488785 2262 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SVIPQ8NHG7 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms