Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms