Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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