Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOP1Q7RTM1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms