Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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USP31Q70CQ4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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USP31Q70CQ4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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USP31Q70CQ4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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USP31Q70CQ4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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USP31Q70CQ4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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USP31Q70CQ4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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USP31Q70CQ4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP31Q70CQ4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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USP31Q70CQ4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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USP31Q70CQ4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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USP31Q70CQ4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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USP31Q70CQ4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP31Q70CQ4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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