Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CCBE1Q6UXH8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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