Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF549Q6P9A3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms