Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CASC4Q6P4E1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC4Q6P4E1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms