Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q6P435 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q6P435 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q6P435 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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