Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TTLL9Q3SXZ7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TTLL9Q3SXZ7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TTLL9Q3SXZ7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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